09 Trường Hợp Cơ Quan Thuế Được Kiểm Tra Tại Trụ Sở Người Nộp Thuế Từ 01/07/2026

1. Hồ Sơ Thuộc Diện Kiểm Tra Trước Hoàn Thuế

Đây là nhóm hồ sơ có mức độ rủi ro cao hoặc thuộc đối tượng phải kiểm tra trước khi cơ quan thuế ban hành quyết định hoàn thuế.

Doanh nghiệp cần chuẩn bị đầy đủ:

• Hóa đơn chứng từ.

• Hợp đồng kinh tế.

• Hồ sơ thanh toán.

• Chứng từ xuất nhập khẩu (nếu có).

2. Hồ Sơ Thuộc Diện Kiểm Tra Sau Hoàn Thuế

Đối với các hồ sơ hoàn thuế theo cơ chế quản lý rủi ro, cơ quan thuế có thể thực hiện kiểm tra trong thời hạn 05 năm kể từ ngày ban hành quyết định hoàn thuế.

3. Có Dấu Hiệu Vi Phạm Pháp Luật Thuế

Cơ quan thuế có thể tiến hành kiểm tra khi phát hiện các dấu hiệu bất thường như:

Chênh lệch dữ liệu hóa đơn

Kê khai doanh thu không phù hợp

Chi phí bất thường

Dấu hiệu trốn thuế hoặc gian lận thuế

4. Trường Hợp Được Lựa Chọn Theo Kế Hoạch, Chuyên Đề

Hàng năm, cơ quan thuế xây dựng kế hoạch kiểm tra theo:

• Ngành nghề.

• Lĩnh vực kinh doanh.

• Nhóm rủi ro.

• Chuyên đề quản lý thuế.

Doanh nghiệp thuộc danh sách lựa chọn sẽ được kiểm tra theo kế hoạch.

5. Theo Yêu Cầu Của Cơ Quan Có Thẩm Quyền

Kiểm tra được thực hiện khi có văn bản đề nghị hoặc yêu cầu từ:

• Cơ quan điều tra.

• Thanh tra nhà nước.

• Kiểm toán nhà nước.

• Cơ quan quản lý chuyên ngành.

6. Người Nộp Thuế Có Rủi Ro Cao

Đây là nhóm đối tượng được cơ quan thuế đặc biệt quan tâm.

Các trường hợp thường gặp

Chia, tách doanh nghiệp

Sáp nhập hoặc hợp nhất doanh nghiệp

Chuyển đổi loại hình doanh nghiệp

Giải thể, phá sản hoặc chấm dứt hoạt động

Chuyển địa điểm kinh doanh

Có hành vi bỏ địa chỉ kinh doanh

Chấm dứt hiệu lực mã số thuế

7. Trường Hợp Quy Định Tại Điểm R Khoản 2 Điều 22 Luật Quản Lý Thuế 2025

Khi người nộp thuế:

• Không giải trình theo yêu cầu.

• Không bổ sung hồ sơ, tài liệu theo quy định.

• Không cung cấp thông tin phục vụ kiểm tra.

Cơ quan thuế có thể chuyển sang kiểm tra trực tiếp tại trụ sở doanh nghiệp.

8. Kiểm Tra Theo Yêu Cầu Giải Quyết Khiếu Nại, Tố Cáo

Trường hợp phát sinh:

• Khiếu nại liên quan đến thuế.

• Tố cáo hành vi vi phạm pháp luật thuế.

Cơ quan thuế có thể tiến hành xác minh, kiểm tra tại doanh nghiệp để làm rõ nội dung vụ việc.

9. Hồ Sơ Miễn Thuế, Giảm Thuế, Không Thu Thuế Của Người Nộp Thuế Có Rủi Ro Cao

Những hồ sơ liên quan đến:

• Miễn thuế.

• Giảm thuế.

• Không thu thuế.

Nếu thuộc nhóm rủi ro cao sẽ được kiểm tra trước hoặc sau khi giải quyết hồ sơ.

Người Nộp Thuế Có Những Quyền Gì Khi Bị Kiểm Tra?

Luật Quản lý thuế 2025 cũng bảo vệ quyền lợi hợp pháp của người nộp thuế trong quá trình kiểm tra.

Quyền Được Giải Trình

Người nộp thuế có quyền giải thích các nội dung liên quan đến cuộc kiểm tra và bảo lưu ý kiến của mình.

Quyền Khiếu Nại, Khởi Kiện

Có quyền:

• Khiếu nại quyết định hành chính.

• Khởi kiện theo quy định pháp luật.

• Yêu cầu bồi thường thiệt hại nếu phát sinh.

Quyền Tố Cáo Hành Vi Vi Phạm

Người nộp thuế có quyền tố cáo các hành vi vi phạm pháp luật trong quá trình thanh tra, kiểm tra thuế.

Doanh Nghiệp Cần Làm Gì Để Giảm Rủi Ro Kiểm Tra Thuế?

Rà Soát Hồ Sơ Thuế Định Kỳ

Kiểm tra tính đầy đủ và chính xác của:

• Tờ khai thuế.

• Hóa đơn điện tử.

• Sổ sách kế toán.

• Báo cáo tài chính.

Kiểm Soát Rủi Ro Hóa Đơn

Đối chiếu dữ liệu hóa đơn đầu vào và đầu ra thường xuyên.

Chuẩn Bị Hồ Sơ Giải Trình

Lưu trữ đầy đủ:

• Hợp đồng.

• Biên bản nghiệm thu.

• Chứng từ thanh toán.

• Hồ sơ liên quan đến các khoản chi phí.

Chủ Động Tuân Thủ Quy Định Thuế

Việc tuân thủ đúng quy định không chỉ giúp hạn chế kiểm tra mà còn giảm thiểu nguy cơ bị truy thu và xử phạt.

Kết Luận

Từ ngày 01/07/2026, Luật Quản lý thuế 2025 mở rộng và làm rõ các trường hợp cơ quan thuế được kiểm tra tại trụ sở người nộp thuế. Doanh nghiệp cần chủ động rà soát hồ sơ, kiểm soát rủi ro và nâng cao tính tuân thủ để sẵn sàng trước các cuộc kiểm tra của cơ quan thuế.
 

Hotline: 0966 002 638
Email: [email protected]
Website: https://ketoanthuedaiduong.com/

Kế Toán Đại Dương – Đồng hành cùng doanh nghiệp trong mọi vấn đề về kế toán và thuế.